.
Tập tin dữ liệu tạo ra từ phần mềm phân tích hình ảnh chip gene; bao gồm dữ liệu trích ra từ “đoạn mồi” trên Affymetrix GeneChip; có thể chưa hàng nghìn điểm dữ liệu và có thể có kích thước lớn; có thể được xử lý bằng thuật toán phần mềm và ảnh hóa trên hệ thống lưới 2D như là một phần có thí nghiệp toàn thể bộ gene. Một Affymetrix GeneChip là một chip sinh học chứ một chip gene thích hợp cho một thí nghiệm. Để tạo những con chip, một mảnh kính hoặc đĩa silicon được xếp với các đoạn mồi, báo cáo mức độ biểu hiện như là giá trị phù hợp (perfect match – PM) và không phù hợp (mismatch – MM), dựa vào chúng có bổ sung vào đoạn DNA mẫu gốc hay không. Những giá trị có thể thể được sử dụng để nghiên cứu sự thay đổi của DNA, được gọi là single-nucleotide polymorphisms (SNPs), được sử dụng trong nghiên cứu ở người và động vật. Định dạng tập tin CEL có nhiều phiên bản, sử dụng nhiều định dạng khác nhau. Ví dụ, phiên bản 3 sử dụng định dạng văn bản ASCII trong khi phiên bản 4 sử dụng định dạng nhị phân. Ghi chú: những tập tin CEL đòi hỏi tập tin .CDF tương ứng, là một từ điển.